委托報關網上業(yè)務流程（在進行此項操作前必須先按照網上報關委托業(yè)務的流程建立委托關系）：
1．代理報關單錄入業(yè)務流程：
（1）代理報關單位持“報關單錄入持”操作員卡的操作員進入中國電子口岸“報關單錄入”界面，在備案數據下載協議的授權范圍內下載本委托單位的征免稅證明、加工貿易手冊或加工區(qū)備案清單后，脫機錄入報關單數據（數據暫存在本地數據庫）。
（2）錄入并提交后將錄入的報關單數據信息上載到數據中心。
2．代理報關審核申報業(yè)務流程：
代理報關單位持“報關單審核申報”權操作員卡的操作員進入中國電子口岸的“報關單審核申報”界面，對報關單的邏輯性、填報的規(guī)范性進行審核，確保報關單可以向海關進行申報。則需要將報關單下載本地進行修改，修改后的報關單需重新上載到數據中心，并且需要重新進行審核。審核通過后進入自理報關申報確認業(yè)務流程。
3．代理報關申報確認業(yè)務流程：
（1）代理報關單位持具“報關單申報確認”持操作員卡的企業(yè)管理人員進入中國電子口岸“報關單申報確認”界面，對報關單進行確認申報操作，經“申報確認”后的報關單通過公共數據中心傳海關內部網。如果申報確認時認為報關單的填制不符合邏輯，需要將報關單數據下載到本地進行修改，修改完畢之后需要將數據重新上載到數據中心，并且重新進行審核和申報確認。
（2）代理報關單位打印出經海關審核通過的報關單，并攜帶其他單證去海關辦理其他通關手續(xù)。
