北京兒童醫(yī)院共有在職職工3210人，其中醫(yī)生968人，護(hù)士1325人，醫(yī)技462人。正高級(jí)職稱292人，副高級(jí)職稱380人，中級(jí)職稱692人。醫(yī)院擁有中國現(xiàn)代兒科學(xué)奠基人諸福棠、中國兒童血液腫瘤學(xué)開創(chuàng)者胡亞美、中國小兒外科創(chuàng)始人之一張金哲等國內(nèi)兒科界僅有的三位院士，以及突出貢獻(xiàn)專家、享受政府特殊津貼人員、新世紀(jì)百千萬人才工程人選、國家杰出青年科學(xué)基金獲得者等眾多高層次人才。
北京兒童醫(yī)院積極發(fā)揮學(xué)科作用，領(lǐng)航兒科行業(yè)發(fā)展。2013年?duì)款^組建北京兒童醫(yī)院集團(tuán)，創(chuàng)新“病人不動(dòng)、醫(yī)生移動(dòng)”的模式服務(wù)全國患兒，目前理事單位成員已達(dá)57家。醫(yī)院與美國、俄羅斯、加拿大、意大利、澳大利亞、瑞典、德國、法國、日本、新加坡等國家的兒童醫(yī)療機(jī)構(gòu)和科研院所建立了良好的關(guān)系和廣泛的合作，是科技部認(rèn)定的兒童重大疾病國際科技合作基地。
國家兒童醫(yī)學(xué)中心首都醫(yī)科大學(xué)附屬北京兒童醫(yī)院白血病專業(yè)在胡亞美院士帶領(lǐng)下，從1976年率先在國內(nèi)開展兒童白血病診治，1998年至今血液專業(yè)被評為北京市重點(diǎn)學(xué)科。目前北京兒童醫(yī)院(北京病區(qū))每年收治兒童和青少年白血病患兒近300例，北京兒童醫(yī)院保定病區(qū)每年收治兒童和青少年白血病患兒近100例。
白血病是起源于骨髓的一種惡性腫瘤，兒童和青少年白血病發(fā)病率為十萬分之四左右，即每年我國新發(fā)1.5-2萬例。隨著科學(xué)技術(shù)的發(fā)展，兒童白血病診治水平不斷提高，目前兒童急性淋巴細(xì)胞白血病的率已達(dá)80%以上、急性髓細(xì)胞白血病率達(dá)70%以上、急性早幼粒細(xì)胞白血病率達(dá)95%以上。據(jù)2020年底統(tǒng)計(jì)，北京兒童醫(yī)院已白血病患兒3000余人，其中不少孩子已長大成人，進(jìn)入大學(xué)學(xué)習(xí)和走上工作崗位，并且結(jié)婚生育了100多名健康的小寶寶。
從2008年起，在吳敏媛教授帶領(lǐng)下白血病專業(yè)組牽頭開展了全國兒童白血病多中心診治研究，之后白血病團(tuán)隊(duì)不斷提高全國兒童和青少年白血病診治的同質(zhì)化水平，是國家衛(wèi)生健康委制定白血病臨床路徑和診療規(guī)范的牽頭單位。從2015年起，我們不斷優(yōu)化方案，在經(jīng)典化療的基礎(chǔ)上開展兒童和青少年白血病的靶向和免疫，逐漸減化療和去化療，明顯降低了白血病過程中的毒副作用。在白血病診治過程中同時(shí)開展多學(xué)科聯(lián)合診治及人文關(guān)懷，每年舉辦“六一”兒童聯(lián)歡會(huì)，使患兒不僅獲得軀體疾病的，更獲得精神心理的康復(fù)，明顯提高了康復(fù)兒童的生存質(zhì)量。2023年7月下旬，白血病科病房由西城本部院區(qū)遷至北京兒童醫(yī)院順義婦兒醫(yī)院院區(qū)，床位由40余張擴(kuò)大至90張。
白血病專業(yè)組注重臨床科研及轉(zhuǎn)化醫(yī)學(xué)研究，負(fù)責(zé)國家及省部級(jí)科研項(xiàng)目30余項(xiàng)。開展了“兒童和青少年白血病的多學(xué)科綜合”、“白血病基因?qū)W分型和個(gè)性化”、“兒童白血病微小殘留病”等多項(xiàng)研究，獲科技成果獎(jiǎng)10余項(xiàng)，發(fā)表研究論文200余篇。
2001年，在胡亞美院士和吳敏媛教授的直接領(lǐng)導(dǎo)下，成立北京兒童醫(yī)院血液病中心造血干細(xì)胞移植專業(yè)組，是國內(nèi)早系統(tǒng)開展兒童造血干細(xì)胞移植工作的中心之一。2021年，在原有血液腫瘤中心干細(xì)胞移植病房基礎(chǔ)上，成立了北京兒童醫(yī)院干細(xì)胞移植科，同年 6月，干細(xì)胞移植科在北京兒童醫(yī)院保定醫(yī)院，成立了我國北方、保定的兒童造血干細(xì)胞移植中心，現(xiàn)干細(xì)胞移植科分為2個(gè)病區(qū)，北京病區(qū)（本部）和保定病區(qū)， 2個(gè)病區(qū)共20間百級(jí)移植倉，6間千級(jí)移植倉，2個(gè)干細(xì)胞采集室，1個(gè)干細(xì)胞實(shí)驗(yàn)室，每年進(jìn)行150-250例造血干細(xì)胞移植，是目前我國北方的兒童造血干細(xì)胞移植中心，秦茂權(quán)帶領(lǐng)其團(tuán)隊(duì)分別長駐北京和保定同時(shí)開展干細(xì)胞移植工作，保證及管理的同質(zhì)化。