北京市級(jí)平臺(tái)：
北京市兒童外科矯形器具工程技術(shù)研究中心
兒童重大疾病北京市國(guó)際科技合作基地
◆ 北京市重點(diǎn)學(xué)科：
急救專業(yè)、普外專業(yè)、小兒白血病專業(yè)、中醫(yī)小兒脾胃病專業(yè)
◆ 北京市重點(diǎn)實(shí)驗(yàn)室：
兒童耳鼻咽喉頭頸外科
兒童血液病與腫瘤分子分型
兒童呼吸道感染性疾病研究
兒童慢性腎臟病與血液凈化
出生缺陷遺傳學(xué)研究
2001年，在胡亞美院士和吳敏媛教授的直接領(lǐng)導(dǎo)下，成立北京兒童醫(yī)院血液病中心造血干細(xì)胞移植專業(yè)組，是國(guó)內(nèi)早系統(tǒng)開展兒童造血干細(xì)胞移植工作的中心之一。2021年，在原有血液腫瘤中心干細(xì)胞移植病房基礎(chǔ)上，成立了北京兒童醫(yī)院干細(xì)胞移植科，同年 6月，干細(xì)胞移植科在北京兒童醫(yī)院保定醫(yī)院，成立了我國(guó)北方、保定的兒童造血干細(xì)胞移植中心，現(xiàn)干細(xì)胞移植科分為2個(gè)病區(qū)，北京病區(qū)（本部）和保定病區(qū)， 2個(gè)病區(qū)共20間百級(jí)移植倉(cāng)，6間千級(jí)移植倉(cāng)，2個(gè)干細(xì)胞采集室，1個(gè)干細(xì)胞實(shí)驗(yàn)室，每年進(jìn)行150-250例造血干細(xì)胞移植，是目前我國(guó)北方的兒童造血干細(xì)胞移植中心，秦茂權(quán)帶領(lǐng)其團(tuán)隊(duì)分別長(zhǎng)駐北京和保定同時(shí)開展干細(xì)胞移植工作，保證及管理的同質(zhì)化。
耳鼻咽喉頭頸外科學(xué)科帶頭人倪鑫，國(guó)家兒童醫(yī)學(xué)中心主任，首都醫(yī)科大學(xué)附屬北京兒童醫(yī)院院長(zhǎng)，主任醫(yī)師，教授，博士生導(dǎo)師。
耳鼻咽喉頭頸外科教授團(tuán)隊(duì):倪鑫、鄭軍、葛文彤、張杰、劉海紅、許志飛、郭永麗、王生才等。
首都醫(yī)科大學(xué)附屬北京兒童醫(yī)院耳鼻咽喉頭頸外科于1975年建科，2023年4月獲批國(guó)家重點(diǎn)臨床專科，成立至今已經(jīng)有近50年歷史?？剖颐嫦蛉珖?guó)兒童患者，以診治耳鼻咽喉及頭頸部常見病和疑難危重疾病為主，是中華醫(yī)學(xué)會(huì)耳鼻咽喉頭頸外科分會(huì)小兒學(xué)組組長(zhǎng)單位和中國(guó)醫(yī)師協(xié)會(huì)耳鼻咽喉頭頸外科分會(huì)小兒學(xué)組組長(zhǎng)單位?，F(xiàn)下設(shè)四個(gè)臨床專業(yè)和三大臨床診療中心，即耳科專業(yè)、鼻科專業(yè)、咽喉專業(yè)和頭頸專業(yè)以及兒童睡眠中心、兒童聽力診療中心和人工耳蝸中心。依托國(guó)家兒童醫(yī)學(xué)中心發(fā)展平臺(tái)，聯(lián)合首都醫(yī)科大學(xué)兒童上氣道阻塞性疾病臨床診療與研究中心、兒童耳鼻咽喉頭頸外科疾病北京市重點(diǎn)實(shí)驗(yàn)室兩大科研支撐平臺(tái)，進(jìn)行臨床-科研-教學(xué)三位一體的學(xué)科建設(shè)，目前已基本建成國(guó)內(nèi)、國(guó)際先進(jìn)的兒童耳鼻咽喉頭頸疾病綜合性基礎(chǔ)和臨床研究平臺(tái)。
科室現(xiàn)擁有醫(yī)療床位34張，睡眠中心床位12張，年門診量約20萬(wàn)人次，年手術(shù)量3500余例?？剖夜灿嗅t(yī)師46人、研究員2人、副研究員1人及技術(shù)人員18人。醫(yī)師中主任醫(yī)師18人，副主任醫(yī)師12人，主治醫(yī)師9人，住院醫(yī)師7人。科室現(xiàn)有教授5人，副教授2人，講師9人;博士研究生導(dǎo)師6人，碩士研究生導(dǎo)師1人。
科室擁有多種國(guó)內(nèi)外的耳鼻咽喉頭頸外科醫(yī)療設(shè)備，如達(dá)芬奇機(jī)器人操作系統(tǒng)，美敦力顱神經(jīng)電生理監(jiān)測(cè)系統(tǒng)，美敦力ENT電磁導(dǎo)航系統(tǒng)，超聲刀系統(tǒng)，蔡司顯微鏡，STORZ超高清鼻內(nèi)鏡系統(tǒng)等，可充分滿足對(duì)兒童耳鼻咽喉頭頸外科所有病種的臨床診療需求。
北京兒童醫(yī)院眼科為擁有專業(yè)門診、病房、醫(yī)技檢查、驗(yàn)光配鏡中心、弱視訓(xùn)練、視感知覺工作室為一體的綜合性兒童眼病診療中心，同時(shí)為北京市殘聯(lián)指定殘疾評(píng)估、康復(fù)中心，并托管北京兒童醫(yī)院保定醫(yī)院、北京市順義區(qū)婦幼保健院、北京兒童醫(yī)院鄭州醫(yī)院、北京兒童醫(yī)院新疆醫(yī)院、北京兒童醫(yī)院黑龍江醫(yī)院。