北京同仁醫(yī)院以醫(yī)院綜合醫(yī)療為主體，北京市眼科研究所、北京市耳鼻咽喉科研究所、北京市糖尿病研究所為附屬科研機(jī)構(gòu)，形成 “一院三所”發(fā)展格局，成為集醫(yī)療、教學(xué)、科研、預(yù)防、國際交流五位一體的醫(yī)療科研聯(lián)合體。眼科、耳鼻咽喉科為國家臨床重點(diǎn)學(xué)科，變態(tài)反應(yīng)(鼻過敏)科為國家臨床重點(diǎn)專科，中醫(yī)眼科學(xué)為中醫(yī)重點(diǎn)學(xué)科。

北京同仁醫(yī)院擁有中國工程院院士1名，國家萬人計(jì)劃4人，長(zhǎng)江學(xué)者1名，百千萬工程人選9人，國家杰出青年基金獲得者2名，國家青年基金獲得者1名，享受政府特殊津貼專家11名，榮獲省部級(jí)突出貢獻(xiàn)專家15人，北京學(xué)者4名，青年北京學(xué)者2名，萬人計(jì)劃教學(xué)名師1人。

北京同仁醫(yī)院作為首都醫(yī)科大學(xué)第四臨床醫(yī)學(xué)院，醫(yī)院承擔(dān)著重要的教學(xué)任務(wù);首都醫(yī)科大學(xué)北京眼科學(xué)院和耳鼻咽喉科學(xué)院設(shè)在醫(yī)院內(nèi)。醫(yī)院現(xiàn)有研究生學(xué)位點(diǎn)28個(gè)，其中博士學(xué)位點(diǎn)13個(gè);碩士研究生導(dǎo)師163名，其中博士研究生導(dǎo)師67名，國家住院醫(yī)師規(guī)范化培訓(xùn)專業(yè)基地16個(gè)。2012年以來，醫(yī)院獲批項(xiàng)目(課題)243項(xiàng)，獲省部級(jí)及以上(含社會(huì)力量獎(jiǎng))31項(xiàng)，其中國家獎(jiǎng)3項(xiàng)。

北京同仁醫(yī)院眼底科堅(jiān)持以臨床服務(wù)為根本，以科研創(chuàng)新為導(dǎo)向，醫(yī)療、教學(xué)、科研、預(yù)防發(fā)展的目標(biāo)，推動(dòng)了創(chuàng)新型的科學(xué)研究工作的持續(xù)開展和學(xué)科臨床服務(wù)水平的不斷提高。