在醫(yī)療實踐的同時，曾學軍教授致力于臨床醫(yī)學教育，任美國內(nèi)科醫(yī)師學會（ACP）Fellow、美國醫(yī)學研究所（IOM）中國醫(yī)學教育代表。曾榮獲北京市高等教育改革二等獎、 “住院醫(yī)師心中好老師”、北京市師德先進個人、北京協(xié)和醫(yī)學院教學名師等榮譽，帶領(lǐng)普通內(nèi)科獲得2015年北京協(xié)和醫(yī)學院教學團隊稱號。2019年2月入選十大社區(qū)健康促進首 席專家。

北京協(xié)和醫(yī)院風濕免疫科為了促進中國風濕病的普及與提高，自建科以來，堅持每年舉辦形式多樣的風濕病學講習班和學術(shù)會議，編著多部風濕病學專著，同時結(jié)合風濕病學臨床的需要開展科學研究，取得了極大的成績，是國家教委風濕病學博士學位授予點、風濕免疫內(nèi)科博士后流動站、國家教委風濕病學重點學科單位、衛(wèi)生部住院醫(yī)師培訓基地、風濕免疫科?？评^續(xù)教育基地、風濕臨床試驗基地、教育部重點實驗室，風濕病學博士生/博士后培養(yǎng)單位，為全國培養(yǎng)了大量風濕病學的專業(yè)人才。

北京協(xié)和醫(yī)院風濕免疫科科室承擔或參與完成了數(shù)十項國家和部委的科研課題，主持和參與眾多國際、國內(nèi)多中心臨床研究以及高質(zhì)量單中心臨床研究，發(fā)表數(shù)百篇SCI收錄論文，主持制定多項風濕免疫病領(lǐng)域臨床診斷和指南，先后獲得12項國家及省部級獎勵，包括3項國家科技進步獎，出版學術(shù)專著多部。為開展具有管理科學、規(guī)范的、符合國際一 流水平的全國大規(guī)模多中心自身免疫病臨床研究奠定了堅實的基礎(chǔ)。

今天的北京協(xié)和醫(yī)院風濕免疫科，是醫(yī)療、教學、科研齊頭并進的科室典范，連續(xù)12年蟬聯(lián)復旦版《中國醫(yī)院?？坡曌u排行榜》風濕?？瓢袷祝B續(xù)9年在《中國醫(yī)院/中國醫(yī)學院?？萍剂恐担⊿TEM）》風濕病學與自體免疫病學中排名第 一，是中國風濕病學領(lǐng)域當之無愧的“領(lǐng)頭羊”。