北京市眼科研究所、北京市耳鼻咽喉科研究所、北京市糖尿病研究所與醫(yī)院主體并稱“一院三所”，成為集醫(yī)療、教學、科研、預防、國際交流五位一體的醫(yī)療科研聯(lián)合體。眼科、耳鼻咽喉科為教育部批準的國家臨床重點學科，變態(tài)反應(鼻過敏)科為原國家衛(wèi)生和計劃生育委員會批準的國家臨床重點?？?，中醫(yī)眼科學為國家中醫(yī)藥管理局批準的中醫(yī)重點學科。首都醫(yī)科大學北京眼科學院和耳鼻咽喉科學院設在院內(nèi)。醫(yī)院設有世界衛(wèi)生組織防盲合作中心和世界衛(wèi)生組織防聾合作中心，附設北京同仁眼庫(國際眼庫協(xié)會會員)。

同仁醫(yī)院現(xiàn)有中國工程院院士1名，北京學者3名，長江學者1名，享受政府特殊津貼專家11名，獲、北京市突出貢獻專家12名。作為首都醫(yī)科大學第四臨床醫(yī)學院，醫(yī)院承擔著重要的教學任務。醫(yī)院現(xiàn)有學位點28個，其中博士學位點13個。碩士生導師114人，博士生導師41人。擁有15個北京市住院醫(yī)師培訓基地。

改革開放以來，醫(yī)院共獲得省部級以上科技成果獎勵138項，其中8項，獲得國家自然科學基金資助項目253項。

同仁醫(yī)院歷經(jīng)百余年發(fā)展，凝練出“精誠勤和”的醫(yī)院精神。在新的歷史時期，同仁人將繼承和發(fā)揚百年同仁優(yōu)良傳統(tǒng)，弘揚主流文化，苦練內(nèi)功，精于內(nèi)涵，團結一致，創(chuàng)新發(fā)展，努力為人民群眾提供優(yōu)質(zhì)、、快捷的醫(yī)療服務。

預約掛號，掛專家號更是“一號難求”,這是當前許多大型醫(yī)院的普遍現(xiàn)象。預約掛號是各地近年來開展的一項便民就醫(yī)服務，旨在縮短看病流程，節(jié)約患者時間。這種預約掛號大多通過醫(yī)療機構提供的電話或者網(wǎng)絡進行，基本上是免費或者只收取很少的手續(xù)費。由于預約掛號需要事先登記患者的信息，并且可以減少在醫(yī)院掛號窗口排隊等待之苦，因此它一定程度上也有利于改善就醫(yī)環(huán)境，促進“實名制”的推行，受到了不少患者的肯定和歡迎。