北京市眼科研究所、北京市耳鼻咽喉科研究所、北京市糖尿病研究所與醫(yī)院主體并稱“一院三所”，成為集醫(yī)療、教學、科研、預防、國際交流五位一體的醫(yī)療科研聯(lián)合體。眼科、耳鼻咽喉科為教育部批準的國家臨床重點學科，變態(tài)反應(鼻過敏)科為原國家衛(wèi)生和計劃生育委員會批準的國家臨床重點?？疲嗅t(yī)眼科學為國家中醫(yī)藥管理局批準的中醫(yī)重點學科。首都醫(yī)科大學北京眼科學院和耳鼻咽喉科學院設在院內(nèi)。醫(yī)院設有世界衛(wèi)生組織防盲合作中心和世界衛(wèi)生組織防聾合作中心，附設北京同仁眼庫(國際眼庫協(xié)會會員)。

同仁醫(yī)院現(xiàn)有中國工程院院士1名，北京學者3名，長江學者1名，享受政府特殊津貼專家11名，獲、北京市突出貢獻專家12名。作為首都醫(yī)科大學第四臨床醫(yī)學院，醫(yī)院承擔著重要的教學任務。醫(yī)院現(xiàn)有學位點28個，其中博士學位點13個。碩士生導師114人，博士生導師41人。擁有15個北京市住院醫(yī)師培訓基地。

雖然網(wǎng)上掛號可以使用身份證號，但是在就診時還是需要帶身份證的。因為好多醫(yī)院需要憑身份證、就診卡或者電子就診卡取號等，為了防止不符合醫(yī)院流程給自己造成不必要的麻煩，一定要記得帶身份證，同時如果患者是在患病后因為某些原因由其他醫(yī)院自行轉診的，需要帶上之前的檢查結果等。

對于一些特殊性的科室（性病、特殊病等），可以做完全保密，完成門診預約，做人性化服務和信息化的科學結合。用戶如果通過電話掛號之后，當日并沒有趕到醫(yī)院，則過期自動退號，掛號費自動退回用戶賬號。