預付款保函的另一個風險是保函的生效時間先于承包商收到的預付款，承包商在不知情的前提下，業(yè)主已經沒收預付款保函而承包商未收到預付款。
還有一種可能的風險，就是預付款已經扣還完畢，而預付款保函沒有及時撤銷，讓業(yè)主有機可乘，留下沒收保函之機。
《中華人民共和國民法典》 第八百零七條 發(fā)包人未按照約定支付價款的，承包人可以催告發(fā)包人在合理期限內支付價款。發(fā)包人逾期不支付的，除根據建設工程的性質不宜折價、拍賣外，承包人可以與發(fā)包人協(xié)議將該工程折價，也可以請求人民法院將該工程依法拍賣。建設工程的價款就該工程折價或者拍賣的價款優(yōu)先受償。
在保函中，出具保函的銀行承諾的內容是重要的，該銀行的承諾必須是“無條件的”和“不可撤消的”?！盁o條件的”即意味著當買方僅憑保函書面稱賣方未履行其交貨義務，要求出具保函銀行按保函金額付款時，買方無需提供其他任何證明，也不管實際原因如何，該銀行必須立即無條件地支付保函金額?！安豢沙废摹笔侵副：陂_立后，在規(guī)定的有效期內是不能撤消的。
買方無時間辦理索償手續(xù)。對失效地點在賣方所在地的保函，當買方獲知賣方未能在遲裝船期內履行交貨義務，此時保函時效也已到，由于地理位置的差異，買方已沒有時間辦理有關索償手續(xù)。所以我們應要求保函有效期至合同遲裝船期后幾個工作日較妥。我們之所以強調是“工作日”主要考慮遇到節(jié)假日的情況。
