財務(wù)軟件需要到財政局備案方可使用，有的代理記賬單位沒有采用財政部批準(zhǔn)的財務(wù)軟件來替代手工記賬。

會計資料交接麻煩、不夠規(guī)范。代理記賬單位在接受委托單位的會計原始憑證及資料時，沒有辦理交接手續(xù)，發(fā)現(xiàn)遺失或毀損時無法查找。

代理記賬機構(gòu)必須有3名以上持有會計從業(yè)資格證書的專職從業(yè)人員，且主管代理記賬業(yè)務(wù)的負(fù)責(zé)人必須具有會計師以上專業(yè)技術(shù)職稱資格。但實際執(zhí)行中，相當(dāng)部分的代理記賬機構(gòu)不符合此規(guī)定。

委托代理記賬的委托人應(yīng)當(dāng)履行下列義務(wù)：

（1）對本單位發(fā)生的經(jīng)濟業(yè)務(wù)事項，應(yīng)當(dāng)填制或者取得符合國家統(tǒng)一的會計制度規(guī)定的原始憑證；

（2）應(yīng)當(dāng)配備專人負(fù)責(zé)日常貨幣收支和保管；

（3）及時向代理記賬機構(gòu)提供真實、完整的原始憑證和其他相關(guān)資料；

（4）對于代理記賬機構(gòu)退回的要求按照國家統(tǒng)一的會計制度規(guī)定進行更正、補充的原始憑證，應(yīng)當(dāng)及時予以更正、補充。

一般，代理機構(gòu)會提供以下業(yè)務(wù)：

1、整理原始單據(jù)、記賬憑證；

2、出具財務(wù)報表（資產(chǎn)負(fù)債表、損益表）；

3、每月納稅申報及稅款交納，年度所得稅匯算清繳；

4、新公司國地稅報到等；

另外，有些機構(gòu)可以提供免費的每月報稅短信通知，郵件通知服務(wù)。